David René Romero Camarena

Ingeniería Genómica Investigador

Inv. Tit. C T.C. Definitivo

Semblanza

David Romero obtuvo la Licenciatura en Investigación Biomédica Básica (1983) en la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM) con una tesis, dirigida por Fernando Bastarrachea, sobre la clonación in vivo de mutaciones en el operón glnALG de Escherichia coli. Su tesis de Maestría en Ciencias (UNAM, 1986), dirigida por Guillermo Dávila, se enmarcó en la genética molecular del metabolismo nitrogenado en Neurospora crassa, identificando el gene estructural para la GOGAT en este organismo. Recibió también el Doctorado en Investigación Biomédica Básica (UNAM, 1991), trabajando con Guillermo Dávila el la identificación de los mecanismos causantes de la formación de rearreglos genómicos en Rhizobium etli. Este trabajo fue distinguido con el Premio Weizmann a la Mejor Tesis Doctoral en Ciencias Naturales (1991), otorgado por la Academia Mexicana de Ciencias y la Asociación de Amigos del Instituto Weizmann. Desde 1986, es miembro del cuerpo de investigadores del Centro de Investigación sobre Fijación de Nitrógeno (CIFN-UNAM), que a partir de 2004 se convirtió en el Centro de Ciencias Genómicas.
Actualmente es Investigador Titular C y Responsable del Programa de Ingeniería Genómica en el Centro de Ciencias Genómicas (CCG) en el Campus Morelos de la UNAM en Cuernavaca. Es miembro fundador tanto del CIFN como del CCG.
Su trabajo se ha dedicado a la comprensión del papel de la recombinación homóloga, la recombinación sitio-específica y la conversión génica en la estructuración del genoma de Rhizobium, así como en la aplicación de estos conocimientos para el desarrollo de estrategias para la ingeniería genómica de este organismo. Ha trabajado también en la organización de plásmidos en Rhizobium y en la identificación de diversos genes involucrados en simbiosis. Sus proyectos en curso incluyen “Papel relativo de la recombinación homóloga y de la unión no-homóloga de extremos en la reparación de cortes en doble cadena en el genoma de Rhizobium“, “Generación de herramientas para ingeniería genómica en Rhizobium“, enfocado a CRISPR-Cas y “Función de dos nuevos genes esenciales en Rhizobium“.
Como profesor, ha impartido más de 90 cursos, tanto a nivel de licenciatura como de posgrado. Ha dirigido las tesis de cinco alumnos de Licenciatura, uno de Maestría y nueve de Doctorado. Ha asesorado también a tres investigadores posdoctorales.
En relación a puestos académico-administrativos en servicio a la comunidad del Centro, ha sido Coordinador Académico del Programa de Posgrado (1988-1993 y 1998-2000), Secretario Académico (2001-2003), Coordinador del Programa de Licenciatura en Ciencias Genómicas (2003-2007) y Director del CCG (2009-2017). En la Facultad de Ciencias de la Universidad Autónoma del Estado de Morelos, fue Coordinador Académico de la Licenciatura en Bioquímica y Biología Molecular (1996-1997).
David Romero es miembro de varias sociedades científicas, incluyendo la Academia Mexicana de Ciencias, la Academia de Ciencias de Morelos, la Sociedad Mexicana de Bioquímica, la Asociación Mexicana de Microbiología, la Sociedad Nacional de Fijación Biológica de Nitrógeno, la Sociedad Mexicana de Ciencias Genómicas, la International Society for Plasmid Biology y la American Society for Microbiology. En éstas, ha sido Presidente de la Sociedad Nacional de Fijación Biológica de Nitrógeno (1991-1995), miembro del Comité Directivo de la Asociación Mexicana de Microbiología (2003-2005), Tesorero de la Sociedad Mexicana de Ciencias Genómicas (2004-2007), Secretario de la International Society for Plasmid Biology (2008-2010), Presidente de la Academia de Ciencias de Morelos (2015-2018) y Vicepresidente (2017-2019) y Presidente Electo (2019-2021) de la Sociedad Mexicana de Bioquímica.

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Publicaciones

AñoPublicaciónPMID
2024Yáñez-Cuna FO, Aguilar-Gómez D, Dávalos A, Romero D. (2024). "Prevalent role of homologous recombination in the repair of specific double-strand breaks in Rhizobium etli .". Frontiers in Microbiology. 15():1333194-1333194. [doi:10.3389/fmicb.2024.1333194]38481790
2022Castellani LG, Luchetti A, Nilsson JF, Pérez-Giménez J, Struck B, Schlüter A, Pühler A, Niehaus K, Romero D, Pistorio M, Torres Tejerizo G. (2022). "RcgA and RcgR, Two Novel Proteins Involved in the Conjugative Transfer of Rhizobial Plasmids.". Mbio. 13(5):-. [doi:10.1128/mbio.01949-22]36073816
2022Martínez-Absalón, S., Guadarrama, C., Dávalos, A., Romero, D.. (2022). "RdsA Is a Global Regulator That Controls Cell Shape and Division in Rhizobium etli .". Frontiers in Microbiology. 13():-. [doi:10.3389/fmicb.2022.858440]35464952
2020Cabañas, N., Becerra, A., Romero, D., Govezensky, T., Espinosa-Aguirre, J.J., Camacho-Carranza, R.. (2020). "Repetitive DNA profile of the amphibian mitogenome.". Bmc Bioinformatics. 21(1):-. [doi:10.1186/s12859-020-3532-8]32429835
2020Bañuelos-Vazquez, L.A., Castellani, L.G., Luchetti, A., Romero, D., Torres Tejerizo, G.A., Brom, S.. (2020). "Role of plant compounds in the modulation of the conjugative transfer of pRet42a". Plos One. 15(8):238218-238218. [doi:10.1371/journal.pone.0238218]32845909
2019Cervantes, L., Miranda-Sánchez, F., Torres Tejerizo, G., Romero, D., Brom, S.. (2019). "Plasmid pSfr64a and the symbiotic plasmid pSfr64b of Sinorhizobium fredii GR64 control each other's conjugative transfer through quorum-sensing elements.". Plasmid. 106():-. [doi:10.1016/j.plasmid.2019.102443]31689451
2019Gonzalez, Victor, Isela Santamaria, Rosa, Bustos, Patricia, Maria Perez-Carrascal, Olga, Vinuesa, Pablo, Juarez, Soledad, Martinez-Flores, Irma, Angel Cevallos, Miguel, Brom, Susana, Martinez-Romero, Esperanza, Romero, David. (2019). "Phylogenomic Rhizobium Species Are Structured by a Continuum of Diversity and Genomic Clusters". Frontiers in Microbiology. 10():-. [doi:10.3389/fmicb.2019.00910]31114559
2019Bañuelos-Vazquez, L.A., Torres Tejerizo, G., Cervantes-De La Luz, L., Girard, L., Romero, D., Brom, S.. (2019). "Conjugative transfer between Rhizobium etli endosymbionts inside the root nodule". Environmental Microbiology. 21(9):3430-3441. [doi:10.1111/1462-2920.14645]31037804
2017Santamaría, R.I., Bustos, P., Pérez-Carrascal, O.M., Miranda-Sánchez, F., Vinuesa, P., Martínez-Flores, I., Juárez, S., Lozano, L., Martínez-Romero, E., Cevallos, M.Á., Romero, D., Dávila, G., Ormeño-Orrillo, E., González, V.. (2017). "Complete Genome Sequences of Eight Rhizobium Symbionts Associated with Common Bean ( Phaseolus vulgaris ).". Genome Announcements. 5(30):-. [doi:10.1128/genomeA.00645-17]28751391
2017Bustos, P., Santamaría, R.I., Pérez-Carrascal, O.M., Acosta, J.L., Lozano, L., Juárez, S., Martínez-Flores, I., Martínez-Romero, E., Cevallos, M.Á., Romero, D., Dávila, G., Vinuesa, P., Miranda, F., Ormeño, E., González, V.. (2017). "Complete Genome Sequences of Three Rhizobium gallicum Symbionts Associated with Common Bean ( Phaseolus vulgaris ).". Genome Announcements. 5(11):-. [doi:10.1128/genomeA.00030-17]28302777
2016Calvillo, G., Romero, D.. (2016). "On the closest point to the origin in transportation polytopes". DISCRETE APPLIED MATHEMATICS. 210():88-102. [doi:10.1016/j.dam.2015.01.027]
2016Hernández-Tamayo, R., Torres-Tejerizo, G., Brom, S., Romero, D.. (2016). "Site-specific bacterial chromosome engineering mediated by IntA integrase from Rhizobium etli". Bmc Microbiology. 16(1):133-133. [doi:10.1186/s12866-016-0755-y]27357704
2015Torres Tejerizo, G., Bañuelos, L.A., Cervantes, L., Gaytán, P., Pistorio, M., Romero, D., Brom, S.. (2015). "Development of molecular tools to monitor conjugative transfer in Rhizobia". JOURNAL OF MICROBIOLOGICAL METHODS. 117():155-163. [doi:10.1016/j.mimet.2015.08.005]26272377
2015Yáñez-Cuna, F.O., Castellanos, M., Romero, D.. (2015). "Biased gene conversion in Rhizobium etli is caused by preferential double-strand breaks on one of the recombining homologs". Journal Of Bacteriology. 198(3):591-599. [doi:10.1128/JB.00768-15]26598365
2014Brom, S., Pistorio, M., Romero, D., Torres-Tejerizo, G.. (2014). "Boundaries for conjugative transfer of rhizobial plasmids: Restraining and releasing factors". Plasticity In Plant-Growth-Promoting And Phytopathogenic Bacteria. 9781461492030():43-54. [doi:10.1007/978-1-4614-9203-0_3]
2014Cubillas, Ciro, Vinuesa, Pablo, Tabche, Maria Luisa, Davalos, Araceli, Vazquez, Alejandra, Hernandez-Lucas, Ismael, Romero, David, Garcia-de los Santos, Alejandro. (2014). "The cation diffusion facilitator protein EmfA of Rhizobium etli belongs to a novel subfamily of Mn<sup>2+</sup>/Fe<sup>2+</sup> transporters conserved in a-proteobacteria". Metallomics. 6(10):1808-1815. [doi:10.1039/c4mt00135d]25054342
2014Rogel, M.A., Bustos, P., Santamaría, R.I., González, V., Romero, D., Cevallos, M.T., Lozano, L., Castro-Mondragón, J., Martínez-Romero, J., Ormeño-Orrillo, E., Martinez-Romero, Esperanza. (2014). "Genomic basis of symbiovar mimosae in Rhizobium etli". Bmc Genomics. 15(1):575-575. [doi:10.1186/1471-2164-15-575]25005495
2014Tejerizo, G.T., Pistorio, M., Althabegoiti, M.J., Cervantes, L., Wibberg, D., Schluter, A., Puhler, A., Lagares, A., Romero, D., Brom, S.. (2014). "Rhizobial plasmid pLPU83a is able to switch between different transfer machineries depending on its genomic background". Fems Microbiology Ecology. 88(3):565-578. [doi:10.1111/1574-6941.12325]24646299
2013Hernández, R., Sohlenkamp, C., Puente, J.L., Brom, S., Romero, D.. (2013). "Characterization of IntA, a bidirectional site-specific recombinase required for conjugative transfer of the symbiotic plasmid of Rhizobium etli CFN42". Journal Of Bacteriology. 195(20):4668-4677. [doi:10.1128/JB.00714-13]23935046
2012Bonilla-Rosso, G., Eguiarte, L.E., Romero, D., Travisano, M., Souza, V.. (2012). "Understanding microbial community diversity metrics derived from metagenomes: Performance evaluation using simulated data sets". Fems Microbiology Ecology. 82(1):37-49. [doi:10.1111/j.1574-6941.2012.01405.x]22554028
2012Tejerizo, G.T., Lozano, L, Gonzalez, V, Bustos, P, Romero, D, Brom, S. (2012). "Draft genome sequence of the bean-nodulating Sinorhizobium fredii strain GR64". Journal Of Bacteriology. 194(24):6978-6978. [doi:10.1128/JB.01882-12]23209231
2012Calvillo, G., Romero, D.. (2012). "The dominance assignment problem". DISCRETE OPTIMIZATION. 9(3):149-158. [doi:10.1016/j.disopt.2012.06.001]
2012Romero, D., Alonso-Pecina, F.. (2012). "Ad hoc heuristic for the cover printing problem". DISCRETE OPTIMIZATION. 9(1):17-28. [doi:10.1016/j.disopt.2011.10.002]
2012Romero Camarena, David René. (2012). "Aspectos bioeticos de la generación de células sintéticas". Valores para la sociedad contemporánea. En qué pueden creer los que no creen. ():456-462.
2011Landeta, C., Dávalos, A., Cevallos, M., Geiger, O., Brom, S., Romero, D.. (2011). "Plasmids with a chromosome-like role in Rhizobia". Journal Of Bacteriology. 193(6):1317-1326. [doi:10.1128/JB.01184-10]21217003
2011Villaseñor, T., Dávalos, A., Lozano, L., Romero, D., García, A.. (2011). "Housekeeping genes essential for pantothenate biosynthesis are plasmid-encoded in Rhizobium etli and Rhizobium leguminosarum". Bmc Microbiology. 11():66-66. [doi:10.1186/1471-2180-11-66]21463532
2011Cervantes, L., Bustos, V., Girard, M., Santamaria, R., Dávila, J., Vinuesa, P., Romero, D., Brom, S.. (2011). "The conjugative plasmid of a bean-nodulating Sinorhizobium fredii strain is assembled from sequences of two Rhizobium plasmids and the chromosome of a Sinorhizobium strain". Bmc Microbiology. 11(1):1-11. [doi:10.1186/1471-2180-11-149]21702991
2009Martinez-Salazar, Jaime M., Zuniga-Castillo, Jacobo, Romero, David. (2009). "Differential roles of proteins involved in migration of Holliday junctions on recombination and tolerance to DNA damaging agents in Rhizobium etli". Gene. 432(1-2):26-32. [doi:10.1016/j.gene.2008.11.009]19071199
2009Castellanos, Mildred, Romero, David. (2009). "The extent of migration of the holliday junction is a crucial factor for gene conversion in Rhizobium etli". Journal Of Bacteriology. 191(15):4987-4995. [doi:10.1128/JB.00111-09]19502410
2008Crossman, Lisa C., Castillo-Ramirez, Santiago, McAnnula, Craig, Lozano, Luis, Vernikos, Georgios S., Acosta, Jose L., Ghazoui, Zara F., Hernandez-Gonzalez, Ismael, Meakin, Georgina, Walker, Alan W., Hynes, Michael F., Young, J. Peter W., Downie, J. Allan, Romero, David, Johnston, Andrew W. B., Davila, Guillermo, Parkhill, Julian, Gonzalez, Victor. (2008). "A common genomic framework for a diverse assembly of plasmids in the symbiotic nitrogen fixing bacteria". Plos One. 3(7):-. [doi:10.1371/journal.pone.0002567]18596979
2008Sepulveda, E., Perez-Mendoza, D., Ramirez-Romero, M. A., Soto, M. J., Lopez-Lara, I. M., Geiger, O., Sanjuan, J., Brom, S., Romero, D.. (2008). "Modulation of conjugative activity of rhizobial symbiotic plasmids by repression and transcriptional interference". FEBS JOURNAL. 275(1):49-49.
2008Sepulveda, Edgardo, Perez-Mendoza, Daniel, Ramirez-Romero, Miguel A., Soto, Maria J., Lopez-Lara, Isabel M., Geiger, Otto, Sanjuan, Juan, Brom, Susana, Romero, David. (2008). "Transcriptional interference and repression modulate the conjugative ability of the symbiotic plasmid of Rhizobium etli". Journal Of Bacteriology. 190(12):4189-4197. [doi:10.1128/JB.00041-08]18424522
2008Garcfa-de los Santos, Alejandro, Lopez, Erika, Cubillas, Ciro A., Noel, K. Dale, Brom, Susana, Romero, David. (2008). "Requirement of a plasmid-encoded catalase for survival of Rhizobium etli CFN42 in a polyphenol-rich environment". Applied And Environmental Microbiology. 74(8):2398-2403. [doi:10.1128/AEM.02457-07]18310436
2007Sepulveda, Edgardo, Perez-Mendoza, Daniel, Munoz, Socorro, Ramirez-Romero, Miguel A., Soto, Maria Jose, Cervantes, Laura, Herrera-Cervera, Jose A., Lopez-Lara, Isabel Sabel, Geiger, Otto, Sanuan, Juan, Brom, Susana, Romero, David. (2007). "Regulation of conjugal transfer of the Rhizobium etli Sym plasmid.". Plasmid. 57(2):220-221.
2007Romero, D., Sánchez-Arroyo, A.. (2007). "Adding evidence to the Erdos-Faber-Lovász conjecture". Ars Combinatoria. 85():71-84.
2007Romero, D., Zertuche, F.. (2007). "Number of different binary functions generated by NK -Kauffman networks and the emergence of genetic robustness". JOURNAL OF MATHEMATICAL PHYSICS. 48(8):-. [doi:10.1063/1.2768747]
2007Romero, David, Garcia-De Los Santos, Alejandro, Brom, Susana. (2007). "Essential plasmids in Rhizobium.". Plasmid. 57(2):227-227.
2007Top, Eva, Romero, David. (2007). "Evolution and ecology - Summary". Plasmid. 57(2):223-225.
2007Pinero, Silvia, Rivera, Javier, Romero, David, Cevallos, Miguel Angel, Martinez, Alfredo, Bolivar, Francisco, Gosset, Guillermo. (2007). "Tyrosinase from Rhizobium etli is involved in nodulation efficiency and symbiosis-associated stress resistance". JOURNAL OF MOLECULAR MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY. 13(1-3):35-44. [doi:10.1159/000103595]17693711
2007Granados, M., Gómez, N., Mora, Yolanda, Delgado, M.J., Romero, D., Girard, M.. (2007). "Novel reiterated Fnr-type proteins control the production of the symbiotic terminal oxidase cbb3 in Rhizobium etli CFN42". Molecular Plant-Microbe Interactions. 20(10):1241-1249. [doi:10.1094/MPMI-20-10-1241]17918626
2005Perez-Mendoza, D, Sepulveda, E, Pando, V, Munoz, S, Nogales, J, Olivares, J, Soto, MJ, Herrera-Cervera, JA, Romero, D, Brom, S, Sanjuan, J. (2005). "Identification of the rctA gene, which is required for repression of conjugative transfer of rhizobial symbiotic megaplasmids". Journal Of Bacteriology. 187(21):7341-7350. [doi:10.1128/JB.187.21.7341-7350.2005]16237017
2005Santoyo, G, Martinez-Salazar, JM, Rodriguez, C, Romero, D. (2005). "Gene conversion tracts associated with crossovers in Rhizobium etli". Journal Of Bacteriology. 187(12):4116-4126. [doi:10.1128/JB.187.12.4116-4126.2005]15937174
2005Santoyo, G., Romero, D.. (2005). "Gene conversion and concerted evolution in bacterial genomes". Fems Microbiology Reviews. 29(2):169-183. [doi:10.1016/j.femsre.2004.10.004]15808740
2005Romero, D.. (2005). "Revista Latinoamericana de Microbiologia: Message from the Editor in chief". Revista Latinoamericana De Microbiologia. 47(1-2):5-5.
2005Romero, D., Zertuche, F.. (2005). "Grasping the connectivity of random functional graphs". STUDIA SCIENTIARUM MATHEMATICARUM HUNGARICA. 42(1):1-9. [doi:10.1556/SScMath.42.2005.1.1]
2004Zuniga-Castillo, J, Romero, D, Martinez-Salazar, JM. (2004). "The recombination genes addAB are not restricted to gram-positive bacteria: Genetic analysis of the recombination initiation enzymes recF and addAB in Rhizobium etli". Journal Of Bacteriology. 186(23):7905-7913. [doi:10.1128/JB.186.23.7905-7913.2004]15547262
2004Brom, S., Girard, M., Tun, C., García, A., Bustos, V., González, V., Romero, D.. (2004). "Transfer of the symbiotic plasmid of Rhizobium etli CFN42 requires cointegration with p42a, which may be mediated by site-specific recombination". Journal Of Bacteriology. 186(22):7538-7548. [doi:10.1128/JB.186.22.7538-7548.2004]15516565
2004Sepulveda, Edgardo, Perez-Mendoza, Daniel, Munoz, Socorro, Ramirez-Romero, Miguel A., Soto, Maria Jose, Cervantes, Laura, Herrera-Cervera, Jose A., Lopez-Lara, Isabel Sabel, Geiger, Otto, Sanuan, Juan, Brom, Susana, Romero, David. (2004). "Identification of functional mob regions in Rhizobium etli: Evidence for self-transmissibility of the symbiotic plasmid pRetCFN42d". Journal Of Bacteriology. 186(17):5753-5761. [doi:10.1128/JB.186.17.5753-5761.2004]15317780
2004Pérez, J., Pazos, R.A., Frausto, J., Rodríguez, G., Romero, D., Cruz, L.. (2004). "A statistical approach for algorithm selection". LECTURE NOTES IN COMPUTER SCIENCE. 3059():417-431. [doi:10.1007/978-3-540-24838-5_31]
2003Romero, D., Zertuche, F.. (2003). "The asymptotic number of attractors in the random map model". JOURNAL OF PHYSICS A-MATHEMATICAL AND GENERAL. 36(13):3691-3700. [doi:10.1088/0305-4470/36/13/304]
2003González, V., Bustos, V., Ramírez, M., Medrano, L., Salgado, H., Hernández, I., Hernández, J., Quintero, V., Moreno, G., Girard, M., Rodríguez, O., Flores, M., Cevallos, M., Collado, P., Romero, D., Dávila, J.. (2003). "The mosaic structure of the symbiotic plasmid of Rhizobium etli CFN42 and its relation to other symbiotic genome compartments.". Genome Biology. 4(6):-. [doi:10.1186/gb-2003-4-6-r36]12801410
2003Jahn, OJ, Davila, G, Romero, D, Noel, KD. (2003). "BacS: An abundant bacteroid protein in Rhizobium etli whose expression ex planta requires nifA". Molecular Plant-Microbe Interactions. 16(1):65-73. [doi:10.1094/MPMI.2003.16.1.65]12580283
2003Pérez O., J., Pazos R., R.A., Romero, D., Santaolaya S., R., Rodriguez O., G., Sosa S., V.. (2003). "Adaptive and scalable allocation of data-objects in the web". LECTURE NOTES IN COMPUTER SCIENCE. 2667():134-143. [doi:10.1007/3-540-44839-x_15]
2002Falcon, LI, Escobar-Briones, E, Romero, D. (2002). "Nitrogen fixation patterns displayed by cyanobacterial consortia in Alchichica crater-lake, Mexico". Hydrobiologia. 467(1-3):71-78. [doi:10.1023/A:1014984629985]
2002Ramírez Alfonsín, J.L., Romero, D.. (2002). "Embeddability of the combinohedron". DISCRETE MATH. 254(1-3):473-483. [doi:10.1016/S0012-365X(01)00298-9]
2001López, O., Morera, C., Miranda-Ríos, J., Girard, M., Romero, D., Soberón, M.. (2001). "Regulation of gene expression in response to oxygen in Rhizobium etli: Role of FnrN in fixNOQP expression and in symbiotic nitrogen fixation". Journal Of Bacteriology. 183(24):6999-7006. [doi:10.1128/JB.183.24.6999-7006.2001]11717256
2001Díaz-Leal, H., Martínez-Bernal, J., Romero, D.. (2001). "Dimension of the fixed point set of a nilpotent endomorphism on the flag variety". BOL SOC MAT MEX. 7(1):23-33.
2000Girard, M., Brom, S., Dávalos, A., López, O., Soberón, M., Romero, D.. (2000). "Differential regulation of fixN-reiterated genes in Rhizobium etli by a novel fixL-fixK cascade". Molecular Plant-Microbe Interactions. 13(12):1283-1292. [doi:10.1094/MPMI.2000.13.12.1283]11106020
2000Flores, M, Mavingui, P, Perret, X, Broughton, WJ, Romero, D, Hernandez, G, Davila, G, Palacios, R. (2000). "Prediction, identification, and artificial selection of DNA rearrangements in Rhizobium: Toward a natural genomic design". PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA. 97(16):9138-9143. [doi:10.1073/pnas.97.16.9138]10922070
2000Brom, S, Garcia-de los Santos, A, Cervantes, L, Palacios, R, Romero, D. (2000). "In Rhizobium etli symbiotic plasmid transfer, nodulation competitivity and cellular growth require interaction among different replicons". Plasmid. 44(1):34-43. [doi:10.1006/plas.2000.1469]10873525
2000Reyes, J.D., Tabche, M.L., Morera, C., Girard, M., Romero, D., Krol, E., Miranda, J., Soberón, M.. (2000). "Expression pattern of Rhizobium etli ccmIEFH genes involved in c-type cytochrome maturation". Gene. 250(1-2):149-157. [doi:10.1016/S0378-1119(00)00176-1]10854788
2000Valencia-Morales, E, Romero, D. (2000). "Recombination enhancement by replication (RER) in Rhizobium etli". Genetics. 154(3):971-983. 10757747
2000Martinez-Salazar, JM, Romero, D. (2000). "Role of the ruvB gene in homologous and homeologous recombination in Rhizobium etli". Gene. 243(1-2):125-131. [doi:10.1016/S0378-1119(99)00548-X]10675620
1999Romero, D., Barrón, C., Gómez, S.. (1999). "The optimal geometry of Lennard-Jones clusters: 148-309". COMPUTER PHYSICS COMMUNICATIONS. 123(1-3):87-96. [doi:10.1016/s0010-4655(99)00259-3]
1999Thieffry, D., Romero, D.. (1999). "The modularity of biological regulatory networks.". Biosystems. 50(1):49-59. [doi:10.1016/s0303-2647(98)00087-2]10235650
1999Barrón, C., Gómez, S., Romero, D., Saavedra, A.. (1999). "A genetic algorithm for Lennard-Jones atomic clusters". Applied Mathematics Letters. 12(7):85-90. [doi:10.1016/S0893-9659(99)00106-8]
1999Corvera, A., Prome, D., Prome, J.C., Martínez, M., Romero, D.. (1999). "The nolL gene from Rhizobium etli determines nodulation efficiency by mediating the acetylation of the fucosyl residue in the nodulation factor". Molecular Plant-Microbe Interactions. 12(3):236-246. [doi:10.1094/MPMI.1999.12.3.236]10065560
1999Brom, S., Romero, D.. (1999). "Plasmid biology 98: international symposium on plasmid biology". Plasmid. 41(2):141-177. 10087219
1999Romero, D, Martinez-Salazar, J, Ortiz, E, Rodriguez, C, Valencia-Morales, E. (1999). "Repeated sequences in bacterial chromosomes and plasmids: A glimpse from sequenced genomes". Research In Microbiology. 150(9-10):735-743. [doi:10.1016/S0923-2508(99)00119-9]10673011
1998Rodriguez, C, Romero, D. (1998). "Multiple recombination events maintain sequence identity among members of the nitrogenase multigene family in Rhizobium etli". Genetics. 149(2):785-794. 9611191
1998Mavingui, P, Laeremans, T, Flores, M, Romero, D, Martinez-Romero, E, Palacios, R. (1998). "Genes essential for nod factor production and nodulation are located on a symbiotic amplicon (AMPRtrCFN299pc60) in Rhizobium tropici". Journal Of Bacteriology. 180(11):2866-2874. [doi:10.1128/JB.180.11.2866-2874.1998]9603874
1997Romero, D., Palacios, R.. (1997). "Gene amplification and genomic plasticity in prokaryotes". Annual Review of Genetics. 31():91-111. [doi:10.1146/annurev.genet.31.1.91]9442891
1997Mavingui, A., Flores, M., Romero, D., Martínez, M., Palacios, R.. (1997). "Generation of Rhizobium Strains with Improved Symbiotic Properties by Random Dna Amplification (RDA)". Nature Biotechnology. 15(6):564-569. [doi:10.1038/nbt0697-564]9181580
1997Barrón, C., Gómez, S., Romero, D.. (1997). "Lower energy icosahedral atomic clusters with incomplete core". Applied Mathematics Letters. 10(5):25-28. [doi:10.1016/S0893-9659(97)00078-5]
1997Romero, D., Sánchez-Flores, A.. (1997). "Omnipotence in stretchable two-dimensional scaling". MATHEMATICAL SOCIAL SCIENCES. 33(1):1-21. [doi:10.1016/S0165-4896(96)00817-7]
1996Barrón, C., Gómez, S., Romero, D.. (1996). "Archimedean polyhedron structure yields a lower energy atomic cluster". Applied Mathematics Letters. 9(5):75-78. [doi:10.1016/0893-9659(96)00076-6]
1996Girard, L, Valderrama, B, Palacios, R, Romero, D, Davila, G. (1996). "Transcriptional activity of the symbiotic plasmid of Rhizobium etli is affected by different environmental conditions". MICROBIOLOGY-SGM. 142(10):2847-2856. [doi:10.1099/13500872-142-10-2847]
1996Romero, D., Martinez, L., Fionova, L.. (1996). "Computer simulation of grain boundary spatial distribution in a three-dimensional polycrystal with cubic structure". ACTA MATERIALIA. 44(1):391-402. [doi:10.1016/1359-6454(95)00142-X]
1996Santos, AGD, Brom, S, Romero, D. (1996). "Rhizobium plasmids in bacteria-legume interactions". World Journal Of Microbiology & Biotechnology. 12(2):119-125. [doi:10.1007/BF00364676]24415159
1995ROMERO, D, MARTINEZSALAZAR, J, GIRARD, L, BROM, S, DAVILA, G, PALACIOS, R, FLORES, M, RODRIGUEZ, C. (1995). "Discrete amplifiable regions (amplicons) in the symbiotic plasmid of Rhizobium etli CFN42". Journal Of Bacteriology. 177(4):973-980. [doi:10.1128/jb.177.4.973-980.1995]7860608
1994Garduño- Juárez, R., Romero, D.. (1994). "Heuristic methods in conformational space search of peptides". THEOCHEM-J MOL STRUC. 308(C):115-123. [doi:10.1016/0166-1280(94)80097-9]
1993Flores, M., Brom, S., Stepkowsky, T., Girard, M., Dávila, J., Romero, D., Palacios, R.. (1993). "Gene amplification in Rhizobium: Identification and in vivo cloning of discrete amplifiable DNA regions (amplicons) from Rhizobium leguminosarum biovar phaseoli". PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA. 90(11):4932-4936. [doi:10.1073/pnas.90.11.4932]8506337
1992BROM, S, DELOSSANTOS, AG, STEPKOWSKI, T, FLORES, M, DAVILA, G, ROMERO, D, PALACIOS, R. (1992). "DIFFERENT PLASMIDS OF Rhizobium-leguminosarum BV phaseoli ARE REQUIRED FOR OPTIMAL SYMBIOTIC PERFORMANCE". Journal Of Bacteriology. 174(16):5183-5189. [doi:10.1128/jb.174.16.5183-5189.1992]1644746
1992Morales, L.B., Garduñojuárez, R., Romero, D.. (1992). "The multiple-minima problem in small peptides revisited. The Threshold Accepting approach.". JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS. 9(5):951-957. [doi:10.1080/07391102.1992.10507969]1524708
1991Morales, L.B., Garduñojuárez, R., Romero, D.. (1991). "Applications of simulated annealing to the multiple-minima problem in small peptides.". JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS. 8(4):721-735. [doi:10.1080/07391102.1991.10507841]2059338
1991ROMERO, D, BROM, S, MARTINEZSALAZAR, J, GIRARD, ML, FLORES, M, DURAN, L, DELOSSANTOS, AG, PALACIOS, R, DAVILA, G. (1991). "GEONOMIC INSTABILITY IN Rhizobium - FRIEND OR FOE". Advances In Molecular Genetics Of Plant-Microbe Interactions, Vol 1. 10():211-214.
1991MORALES, LB, GARDUNOJUAREZ, R, Romero, D. (1991). "APPLICATIONS OF SIMULATED ANNEALING TO THE MULTIPLE-MINIMA PROBLEM IN SMALL PEPTIDES". JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS. 8(4):721-735. 2059338
1991BROM, S, DELOSSANTOS, AG, DELOURDESGIRARD, M, DAVILA, G, PALACIOS, R, ROMERO, D. (1991). "High-frequency rearrangements in Rhizobium leguminosarum bv. phaseoli plasmids". Journal Of Bacteriology. 173(3):1344-1346. [doi:10.1128/jb.173.3.1344-1346.1991]1991727
1991ROMERO, D, BROM, S, MARTINEZSALAZAR, J, GIRARD, MD, PALACIOS, R, DAVILA, G. (1991). "Amplification and deletion of a nod-nif region in the symbiotic plasmid of Rhizobium phaseoli". Journal Of Bacteriology. 173(8):2435-2441. [doi:10.1128/jb.173.8.2435-2441.1991]2013567
1991MARTINEZSALAZAR, JM, ROMERO, D, GIRARD, MD, DAVILA, G. (1991). "Molecular cloning and characterization of the recA gene of Rhizobium phaseoli and construction of recA mutants". Journal Of Bacteriology. 173(10):3035-3040. [doi:10.1128/jb.173.10.3035-3040.1991]2022610
1991GIRARD, MD, FLORES, M, BROM, S, ROMERO, D, PALACIOS, R, DAVILA, G. (1991). "Structural complexity of the symbiotic plasmid of Rhizobium leguminosarum bv. phaseoli". Journal Of Bacteriology. 173(8):2411-2419. [doi:10.1128/jb.173.8.2411-2419.1991]2013564
1990Romero, D.. (1990). "Easy transportation-like problems on K-dimensional arrays". JOURNAL OF OPTIMIZATION THEORY AND APPLICATIONS. 66(1):137-147. [doi:10.1007/BF00940537]
1990MARTINEZ, E, ROMERO, D, PALACIOS, R. (1990). "The Rhizobium Genome". CRITICAL REVIEWS IN PLANT SCIENCES. 9(1):59-93. [doi:10.1080/07352689009382282]
1990Romero, D., Sánchez-Flores, A.. (1990). "Methods for the one-dimensional space allocation problem". COMPUTERS & OPERATIONS RESEARCH. 17(5):465-473. [doi:10.1016/0305-0548(90)90051-8]
1988MARTINEZ, E, FLORES, M, BROM, S, ROMERO, D, DAVILA, G, PALACIOS, R. (1988). "Rhizobium phaseoli: A molecular genetics view". PLANT AND SOIL. 108(1):179-184. [doi:10.1007/BF02370113]
1988ROMERO, D, Singleton, P., SEGOVIA, L, MORETT, E, Bohlool, B.B., PALACIOS, R, DAVILA, G. (1988). "EFFECT OF NATURALLY-OCCURRING nif REITERATIONS ON SYMBIOTIC EFFECTIVENESS IN Rhizobium-phaseoli". Applied And Environmental Microbiology. 54(3):848-850. [doi:10.1128/AEM.54.3.848-850.1988]16347593
1988Flores, M., González, V., Pardo, M.A., Leija, A., Martínez, E., Romero, D., Piñero, D., Dávila, G., Palacios, R.. (1988). "Genomic instability in Rhizobium phaseoli.". Journal Of Bacteriology. 170(3):1191-1196. [doi:10.1128/jb.170.3.1191-1196.1988]3343217
1987FLORES, M, GONZALEZ, V, BROM, S, MARTINEZ, E, PINERO, D, ROMERO, D, DAVILA, G, PALACIOS, R. (1987). "Reiterated DNA sequences in Rhizobium and Agrobacterium spp.". Journal Of Bacteriology. 169(12):5782-5788. [doi:10.1128/jb.169.12.5782-5788.1987]3450286
1986ROMERO, D, DAVILA, G. (1986). "Genetic and biochemical identification of the glutamate synthase structural gene in Neurospora crassa". Journal Of Bacteriology. 167(3):1043-1047. [doi:10.1128/jb.167.3.1043-1047.1986]2943726
1985LEON, P, ROMERO, D, GARCIARRUBIO, A, BASTARRACHEA, F, COVARRUBIAS, AA. (1985). "GLUTAMINE SYNTHETASE-CONSTITUTIVE MUTATION AFFECTING THE glnALG UPSTREAM PROMOTER OF ESCHERICHIA-COLI". Journal Of Bacteriology. 164(3):1032-1038. 2866175