Heladia Salgado Osorio
Genómica Computacional Técnico Académico Tec. Acad. Tit. C T.C. Definitivo SemblanzaHeladia Salgado Osorio estudió la licenciatura en Informática en el Instituto Tecnológico de Zacatepec. Actualmente es Técnico Académico Titular definitivo de tiempo completo en el Programa de Genómica Computacional del Centro de Ciencias Genómicas de la UNAM. Es miembro del Sistema Nacional de Investigadores nivel I desde 2005. Sus aportaciones se enfocan en el área de la bioinformática donde ha colaborado en 36 artículos publicados. Uno de sus objetivos, al colaborar en proyectos de investigación, es establecer estándares de calidad en el desarrollo de software con el fin de reutilizarlos o hacerlos disponibles para la comunidad científica. El grupo en el que colabora actualmente tienen la verificación nivel II en el Modelo de Procesos de Desarrollo de Software MoProsoft. Además, sigue impulsando la implantación de mejores prácticas en proyectos de investigación. Recientemente, dadas las iniciativas de ciencia abierta y con el fin de cumplir con los principios FAIR para la base de datos RegulonDB, iniciaron el proyecto de FAIR-rification de RegulonDB, en colaboración con colegas de la organización ELIXIR. En esta misma línea de ciencia abierta, participó en la implementación del proyecto de Repositorio Institucional de Datos del Centro de Ciencias Genómicas. En sus actividades docentes y de divulgación, destaca su participación como instructora de cursos de bioinformática en el Licenciatura de Ciencias Genómicas, en el Programa de Doctorado de Ciencias Biomédicas y del posgrado de Bioquímica de la UNAM. También, ha participado activamente en coordinar las actividades académicas de los Talleres Internacionales de Bioinformática. Además, ha promovido los vínculos de colaboración con la Software Carpentry Foundation, quienes impulsan las buenas prácticas docentes. Cabe señalar que está certificada como instructora de Software Carpentry. Ligas
|
Teléfono: (777) 3132063
|
Publicaciones
Año | Publicación | PMID |
---|---|---|
2024 | Salgado, H., Gama-Castro, S., Lara, P., Mejia-Almonte, C., Alarcón-Carranza, G., López-Almazo, A.G., Betancourt-Figueroa, F., Peña-Loredo, P., Alquicira-Hernández, S., Ledezma-Tejeida, D., Arizmendi-Zagal, L., Mendez-Hernandez, F., Diaz-Gomez, A.K., Ochoa-Praxedis, E., Muñiz-Rascado, L.J., García-Sotelo, J.S., Flores-Gallegos, F.A., Gómez, L., Bonavides-Martínez, C., Del Moral-Chávez, V.M., Hernández-Alvarez, A.J., Santos-Zavaleta, A., Capella-Gutierrez, S., Gelpi, J.L., Collado-Vides, J.. (2024). "RegulonDB v12.0: a comprehensive resource of transcriptional regulation in E. coli K-12.". Nucleic Acids Research. 52(D1):255-264. [doi:10.1093/nar/gkad1072] | 37971353 |
2024 | Lara, P., Gama-Castro, S., Salgado, H., Rioualen, C., Tierrafría, V.H., Muñiz-Rascado, L.J., Bonavides-Martínez, C., Collado-Vides, J.. (2024). "Flexible gold standards for transcription factor regulatory interactions in Escherichia coli K-12: architecture of evidence types.". Frontiers in Genetics. 15():-. [doi:10.3389/fgene.2024.1353553] | 38505828 |
2023 | Lara, P., Gama-Castro, S., Salgado, H., Claire Rioualen, Tierrafría, V.H., Muñiz-Rascado LJ, Bonavides-Martinez, C., Collado-Vides, J.. (2023). "A Gold Standard for Transcription Factor Regulatory Interactions in Escherichia coli K-12: Architecture of Evidence Types". bioRxiv. ():-. [doi:https://doi.org/10.1101/2023.02.25.530038] | |
2022 | Tierrafría, V.H., Rioualen, C., Salgado, H., Lara, P., Gama-Castro, S., Lally, P., Gómez-Romero, L., Peña-Loredo, P., López-Almazo, A.G., Alarcón-Carranza, G., Betancourt-Figueroa, F., Alquicira-Hernández, S., Polanco-Morelos, J.E., García-Sotelo, J., Gaytan-Nuñez, E., Méndez-Cruz, C.F., Muñiz, L.J., Bonavides-Martínez, C., Moreno-Hagelsieb, G., Galagan, J.E., Wade, J.T., Collado-Vides, J.. (2022). "RegulonDB 11.0: Comprehensive high-throughput datasets on transcriptional regulation in Escherichia coli K-12.". Microbial genomics. 8(5):-. [doi:10.1099/mgen.0.000833] | 35584008 |
2021 | Díaz-Rodríguez, M., Lithgow-Serrano, O., Guadarrama-García, F., Tierrafría, V.H., Gama-Castro, S., Solano-Lira, H., Salgado, H., Rinaldi, F., Méndez-Cruz, C.F., Collado-Vides, J.. (2021). "Lisen&Curate: A platform to facilitate gathering textual evidence for curation of regulation of transcription initiation in bacteria.". BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENE REGULATORY MECHANISMS. 1864(11-12):-. [doi:10.1016/j.bbagrm.2021.194753] | 34461312 |
2020 | Chávez, J., Barberena-Jonas, C., Sotelo-Fonseca, J.E., Alquicira-Hernández, J., Salgado, H., Collado-Torres, L., Reyes, A.. (2020). "Programmatic access to bacterial regulatory networks with regutools.". Bioinformatics. 36(16):4532-4534. [doi:10.1093/bioinformatics/btaa575] | 32573705 |
2019 | Tierrafría, V.H., Mejía-Almonte, C., Camacho-Zaragoza, J.M., Salgado, H., Alquicira, K., Ishida, C., Gama-Castro, S., Collado-Vides, J.. (2019). "MCO: towards an ontology and unified vocabulary for a framework-based annotation of microbial growth conditions.". Bioinformatics. 35(5):856-864. [doi:10.1093/bioinformatics/bty689] | 30137210 |
2019 | Santos-Zavaleta, A., Salgado, H., Gama-Castro, S., Sánchez-Pérez, M., Gómez-Romero, L., Ledezma-Tejeida, D., García-Sotelo, J.S., Alquicira-Hernández, K., Muñiz-Rascado, L.J., Peña-Loredo, P., Ishida-Gutiérrez, C., Velázquez-Ramírez, D.A., Del Moral-Chávez, V., Bonavides-Martínez, C., Méndez-Cruz, C.F., Galagan, J., Collado-Vides, J.. (2019). "RegulonDB v 10.5: tackling challenges to unify classic and high throughput knowledge of gene regulation in E. coli K-12". Nucleic Acids Research. 47(D1):212-220. [doi:10.1093/nar/gky1077] | 30395280 |
2018 | Santos-Zavaleta, Alberto, Sanchez-Perez, Mishael, Salgado, Heladia, Velazquez-Ramirez, David A., Gama-Castro, Socorro, Tierrafria, Victor H., Busby, Stephen J. W., Aquino, Patricia, Fang, Xin, Palsson, Bernhard O., Galagan, James E., Collado-Vides, Julio. (2018). "A unified resource for transcriptional regulation in Escherichia coli K-12 incorporating high-throughput-generated binding data into RegulonDB version 10.0". BMC BIOLOGY. 16(1):91-91. [doi:10.1186/s12915-018-0555-y] | 30115066 |
2018 | Salgado, H., Martínez-Flores, I., Bustamante, V.H., Alquicira-Hernández, K., García-Sotelo, J.S., García-Alonso, D., Collado-Vides, J.. (2018). "Using RegulonDB, the Escherichia coli K-12 Gene Regulatory Transcriptional Network Database.". Current Protocols in Bioinformatics. 61(1):1321-13230. [doi:10.1002/cpbi.43] | 30040192 |
2017 | Perez-Morales, Deyanira, Banda, Maria M., Elizabeth Chau, N. Y., Salgado, Heladia, Martinez-Flores, Irma, Antonio Ibarra, J., Ilyas, Bushra, Coombes, Brian K., Bustamante, Victor H.. (2017). "The transcriptional regulator SsrB is involved in a molecular switch controlling virulence lifestyles of Salmonella". PLOS PATHOGENS. 13(7):-. [doi:10.1371/journal.ppat.1006497] | 28704543 |
2016 | Martínez-Flores I, Pérez-Morales D, Sánchez-Pérez M, Paredes CC, Collado-Vides J, Salgado H, Bustamante VH. (2016). "In Silico clustering of Salmonella global gene expression data reveals novel genes co-regulated with the SPI-1 virulence genes through HilD". SCIENTIFIC REPORTS. 6():37858-37858. [doi:10.1038/srep37858] | 27886269 |
2016 | Gama-Castro, S., Salgado, H., Santos-Zavaleta, A., Ledezma-Tejeida, D., Muñiz-Rascado, L., García-Sotelo, J.S., Alquicira-Hernández, K., Martínez-Flores, I., Pannier, L., Castro-Mondragón, J.A., Medina-Rivera, A., Solano-Lira, H., Bonavides-Martínez, C., Pérez-Rueda, E., Alquicira-Hernández, S., Porrón-Sotelo, L., López-Fuentes, A., Hernández-Koutoucheva, A., Del Moral-Chavez, V., Rinaldi, F., Collado-Vides, J.. (2016). "RegulonDB version 9.0: High-level integration of gene regulation, coexpression, motif clustering and beyond". Nucleic Acids Research. 44(D1):133-143. [doi:10.1093/nar/gkv1156] | 26527724 |
2014 | Martinez, L.C., Martínez, I., Salgado, H., Fernández-Mora, M., Medina, A., Puente, J.L., Collado, P., Bustamante, V.H.. (2014). "In Silico identification and experimental characterization of regulatory elements controlling the expression of the Salmonella csrB and csrC genes". Journal Of Bacteriology. 196(2):325-336. [doi:10.1128/JB.00806-13] | 24187088 |
2013 | Balderas, Y., Savageau, M., Salgado, H., Pérez-Rueda, E, Morett, E., Collado, P.. (2013). "Transcription Factors in Escherichia coli Prefer the holo Conformation". Plos One. 8(6):-. [doi:10.1371/journal.pone.0065723] | 23776535 |
2013 | Salgado, H., Peralta, M., Gama, M., Santos, A., Muñíz, L., Garcia, J., Weiss, V., Solano, H., Martínez, I., Medina, A., Salgado, G., Alquicira, S., Alquicira, K., López, A., Porrón, L., Huerta, A., Bonavides, C., Balderas, Y., Pannier, L., Olvera, M., Labastida, A., Jiménez-Jacinto, V., Vega-Alvarado, L., del Moral, V., Hernández, A., Morett, E., Collado, P.. (2013). "RegulonDB v8.0: Omics data sets, evolutionary conservation, regulatory phrases, cross-validated gold standards and more". Nucleic Acids Research. 41(D1):203-213. [doi:10.1093/nar/gks1201] | 23203884 |
2013 | Weiss, V., Medina-Rivera, A, Huerta, AM, Santos-Zavaleta, A, Salgado, H, Morett, E., Collado-Vides, J. (2013). "Evidence classification of high-throughput protocols and confidence integration in RegulonDB". DATABASE-THE JOURNAL OF BIOLOGICAL DATABASES AND CURATION. 2013():-. [doi:10.1093/database/bas059] | 23327937 |
2012 | Pauling, J., Rottger, R., Neuner, A., Salgado, H., Collado, P., Kalaghatgi, P., Azevedo, V., Tauch, A., Puhlerg, A., Baumbach, J.. (2012). "On the trail of EHEC/EAEC - Unraveling the gene regulatory networks of human pathogenic Escherichia coli bacteria". Integrative Biology. 4(7):728-733. [doi:10.1039/c2ib00132b] | 22318347 |
2012 | Salgado, H., Martínez, I., López, A., Garcia, J., Porrón, L., Muñíz, L., Collado, P.. (2012). "Extracting regulatory networks of Escherichia coli from RegulonDB". Methods in Molecular Biology. 804():179-195. [doi:10.1007/978-1-61779-361-5_10] | 22144154 |
2011 | Medina, A., Abreu-Goodger, C., Thomas-Chollier, M., Salgado, H., Collado, P., Van Helden, J.. (2011). "Theoretical and empirical quality assessment of transcription factor-binding motifs". Nucleic Acids Research. 39(3):808-824. [doi:10.1093/nar/gkq710] | 20923783 |
2011 | Gama, M., Salgado, H., Peralta, M., Santos, A., Muñíz, L., Solano, H., Jimenez-Jacinto, V., Weiss, V., Garcia, J., López, A., Porrón, L., Alquicira, S., Medina, A., Martínez, I., Alquicira, K., Martínez, R., Bonavides, C., Miranda-Ríos, J., Huerta, A., Mendoza-Vargas, A., Collado, L., Taboada, B., Vega-Alvarado, L., Olvera, M., Olvera, L., Grande, R., Morett, E., Collado, P.. (2011). "RegulonDB version 7.0: Transcriptional regulation of Escherichia coli K-12 integrated within genetic sensory response units (Gensor Units)". Nucleic Acids Research. 39(SUPPL. 1):98-105. [doi:10.1093/nar/gkq1110] | 21051347 |
2011 | Salgado Osorio, Heladia, Martínez Flores, Irma, López Fuentes, Alejandra Cristina, Garcia Sotelo, Jair Santiago, Porrón Sotelo, Liliana, Muñíz Rascado, Luis José, Collado Vides, Pedro Julio. (2011). "Extracting regulatory networks of/Escherichia coli/from RegulonDB". Bacterial Molecular Networks: Methods and Protocols. ():-. | |
2010 | Salgado Osorio, Heladia, López Fuentes, Alejandra Cristina, Martínez Flores, Irma, Garcia Sotelo, Jair Santiago, Porrón Sotelo, Liliana, Solano Lira, Hilda, Muñíz Rascado, Luis José, Collado Vides, Pedro Julio. (2010). "Extracting regulatory networks of Escherichia coli from RegulonDB". Bacterial Molecular Networks: Methods and Protocols. ():-. | |
2009 | Mendoza-Vargas, Alfredo, Olvera, Leticia, Olvera, Maricela, Grande, Ricardo, Vega-Alvarado, Leticia, Taboada, Blanca, Jimenez-Jacinto, Veronica, Salgado, Heladia, Juarez, Katy, Contreras-Moreira, Bruno, Huerta, Araceli M., Collado-Vides, Julio, Morett, Enrique. (2009). "Genome-wide identification of transcription start sites, promoters and transcription factor binding sites in E. coli". Plos One. 4(10):-. [doi:10.1371/journal.pone.0007526] | 19838305 |
2009 | Janga, Sarath Chandra, Salgado, Heladia, Martinez-Antonio, Agustino. (2009). "Transcriptional regulation shapes the organization of genes on bacterial chromosomes". Nucleic Acids Research. 37(11):3680-3688. [doi:10.1093/nar/gkp231] | 19372274 |
2009 | Collado-Vides, Julio, Salgado, Heladia, Morett, Enrique, Gama-Castro, Socorro, Jimenez-Jacinto, Veronica, Martinez-Flores, Irma, Medina-Rivera, Alejandra, Muniz-Rascado, Luis, Peralta-Gil, Martin, Santos-Zavaleta, Alberto. (2009). "Bioinformatics resources for the study of gene regulation in bacteria". Journal Of Bacteriology. 91(1):23-31. [doi:10.1128/JB.01017-08] | 18978060 |
2008 | Gama, M., Jiménez, V., Peralta, M., Santos, A., Peñaloza, M., Contreras, B., Segura, J., Muñíz, L., Martínez, I., Salgado, H., Bonavides, C., Abreu, C., Rodríguez, C., Miranda-Ríos, J., Morett, J., Merino, E., Huerta, A., Treviño, L., Collado, P.. (2008). "RegulonDB (version 6.0): Gene regulation model of Escherichia coli K-12 beyond transcription, active (experimental) annotated promoters and Textpresso navigation". Nucleic Acids Research. 36(SUPPL. 1):120-124. [doi:10.1093/nar/gkm994] | 18158297 |
2008 | Hernandez-Romano, Jesus, Carlos-Rivera, Francisco J., Salgado, Heladia, Lamadrid-Figueroa, Hector, Valverde-Garduno, Veronica, Rodriguez, Mario H., Martinez-Barnetche, Jesus. (2008). "Immunity related genes in dipterans share common enrichment of AT-rich motifs in their 5' regulatory regions that are potentially involved in nucleosome formation". Bmc Genomics. 9():326-326. [doi:10.1186/1471-2164-9-326] | 18613977 |
2008 | Hernandez-Lucas, I., Gallego-Hernandez, A. L., Encarnacion, S., Fernandez-Mora, M., Martinez-Batallar, A. G., Salgado, H., Oropeza, R., Calva, E.. (2008). "The LysR-type transcriptional regulator LeuO controls expression of several genes in Salmonella enterica serovar typhi". Journal Of Bacteriology. 190(5):1658-1670. [doi:10.1128/JB.01649-07] | 18156266 |
2007 | Rodríguez-Penagos, C., Salgado, H., Martínez-Flores, I., Collado-Vides, J.. (2007). "NLP-based curation of bacterial regulatory networks". LECTURE NOTES IN COMPUTER SCIENCE. 4394 LNCS():575-586. [doi:10.1007/978-3-540-70939-8_51] | |
2007 | Janga, S., Salgado, H., Martínez, A., Collado, P.. (2007). "Coordination logic of the sensing machinery in the transcriptional regulatory network of Escherichia coli". Nucleic Acids Research. 35(20):6963-6972. [doi:10.1093/nar/gkm743] | 17933780 |
2007 | Rodríguez, C., Salgado, H., Martínez, I., Collado, P.. (2007). "Automatic reconstruction of a bacterial regulatory network using Natural Language Processing". Bmc Bioinformatics. 8():293-293. [doi:10.1186/1471-2105-8-293] | 17683642 |
2007 | Salgado, Heladia, Martinez-Antonio, Agustino, Janga, Sarath Chandra. (2007). "Conservation of transcriptional sensing systems in prokaryotes: A perspective from Escherichia coli". FEBS LETTERS. 581(18):3499-3506. [doi:10.1016/j.febslet.2007.06.059] | 17617412 |
2007 | Janga, S., Salgado, H., Collado, P., Martínez, A.. (2007). "Internal Versus External Effector and Transcription Factor Gene Pairs Differ in Their Relative Chromosomal Position in Escherichia coli". Journal Of Molecular Biology. 368(1):263-272. [doi:10.1016/j.jmb.2007.01.019] | 17321548 |
2007 | Rodríguez Penagos, Carlos, Martínez Flores, Irma, Salgado Osorio, Heladia, Collado Vides, Pedro Julio. (2007). "NLP-based curation of bacterial regulatory networks". Computational Linguistics And Intelligent Text Processing. 4394():575-. | |
2007 | Rodríguez Penagos, Carlos, Salgado Osorio, Heladia, Martínez Flores, Irma, Collado Vides, Pedro Julio. (2007). "NLP-Based Curation of Bacterial Regulatory Networks". CICLing. ():575-586. | |
2006 | Salgado, H., Santos, A., Gama, M., Peralta, M., Peñaloza, M., Martínez, A., Karp, P.D., Collado, P.. (2006). "The comprehensive updated regulatory network of Escherichia coli K-12". Bmc Bioinformatics. 7():5-5. [doi:10.1186/1471-2105-7-5] | 16398937 |
2006 | Martínez, A., Janga, S., Salgado, H., Collado, P.. (2006). "Internal-sensing machinery directs the activity of the regulatory network in Escherichia coli". TRENDS IN MICROBIOLOGY. 14(1):22-27. [doi:10.1016/j.tim.2005.11.002] | 16311037 |
2006 | Salgado, H., Gama, M., Peralta, M., Díaz, E., Sánchez, E., Santos, A., Martínez, I., Jiménez, V., Bonavides, C., Segura, J., Martínez, A., Collado, P.. (2006). "RegulonDB (version 5.0): Escherichia coli K-12 transcriptional regulatory network, operon organization, and growth conditions.". Nucleic Acids Research. 34(Database issue):394-397. [doi:10.1093/nar/gkj156] | 16381895 |
2006 | Santos-Zavaleta, A., Salgado, H., Gama-Castro, S., Peralta-Gil, M., Contreras-Moreira, B., Penaloza-Spinola, M., I, Collado-Vides, J.. (2006). "RegulonDB. The most important database in transcriptional regulatory network, operon organization, and growth conditions of Escherichia coli K12". Proceedings Of The Fifth International Conference On Bioinformatics Of Genome Regulation And Structure, Vol 3. ():323-323. | |
2004 | Oviedo, N.A., Salgado, H., Collado, P., Guarneros, G.. (2004). "Distribution of minigenes in the bacteriophage lambda chromosome". Gene. 329(1-2):115-124. [doi:10.1016/j.gene.2003.12.031] | 15033534 |
2004 | Salgado, H., Gama, M., Martínez, A., Díaz, E., Sánchez, E., Peralta, M., García, D., Jiménez, V., Santos, A., Bonavides, C., Collado, P.. (2004). "RegulonDB (version 4.0): Transcriptional regulation, operon organization and growth conditions in Escherichia coli K-12". Nucleic Acids Research. 32(DATABASE ISS.):303-306. [doi:10.1093/nar/gkh140] | 14681419 |
2003 | Martínez, A., Salgado, H., Gama, M., Gutiérrez, R., Jiménez, V., Collado, P.. (2003). "Environmental Conditions and Transcriptional Regulation in Escherichia coli: A Physiological Integrative Approach". BIOTECHNOLOGY AND BIOENGINEERING. 84(7):743-749. [doi:10.1002/bit.10846] | 14708114 |
2003 | González, V., Bustos, V., Ramírez, M., Medrano, L., Salgado, H., Hernández, I., Hernández, J., Quintero, V., Moreno, G., Girard, M., Rodríguez, O., Flores, M., Cevallos, M., Collado, P., Romero, D., Dávila, J.. (2003). "The mosaic structure of the symbiotic plasmid of Rhizobium etli CFN42 and its relation to other symbiotic genome compartments.". Genome Biology. 4(6):-. [doi:10.1186/gb-2003-4-6-r36] | 12801410 |
2002 | Collado Vides, Pedro Julio, Moreno Hagelsieb, Gabriel, Pérez Rueda, Ernesto, Salgado Osorio, Heladia, Huerta Moreno, Araceli, Gutiérrez Ríos, Rosa María, Rosenblueth, David A., Christen, Andrés, Benítez Bellón, Esperanza, Medrano Soto, Luis Arturo, Gama Castro, Ma. del Socorro, Santos Zavaleta, Alberto, Bonavides Martínez, César Augusto, DíPeredo, Edgar, Sánchez Solano, Erika Fabiola, Millá, Dulce María. (2002). "Genomics of Gene Regulation: The view from Escherichia coli". Gene Regulation and Metabolism, Post-Genomic Computational Approaches. ():103-128. | |
2001 | Salgado, H, Santos-Zavaleta, A, Gama-Castro, S, Millen-Zarate, D, Diaz-Peredo, E, Sanchez-Solano, F, Pérez-Rueda, E, Bonavides-Martinez, C, Collado-Vides, J. (2001). "RegulonDB (version 3.2): Transcriptional regulation and operon organization in Escherichia coli K-12". Nucleic Acids Research. 29(1):72-74. [doi:10.1093/nar/29.1.72] | 11125053 |
2000 | Salgado, H., Moreno, G., Smith, T.F., Collado, P.. (2000). "Operons in Escherichia coli: Genomic analyses and predictions". PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA. 97(12):6652-6657. [doi:10.1073/pnas.110147297] | 10823905 |
2000 | Salgado, H, Santos-Zavaleta, A, Gama-Castro, S, Millan-Zarate, D, Blattner, FR, Collado-Vides, J. (2000). "RegulonDB (version 3.0): Transcriptional regulation and operon organization in Escherichia coli K-12". Nucleic Acids Research. 28(1):65-67. [doi:10.1093/nar/28.1.65] | 10592182 |
1999 | Salgado, H, Santos, A, Garza-Ramos, U, van Helden, J, Diaz, E, Collado-Vides, J. (1999). "RegulonDB (version 2.0): A database on transcriptional regulation in Escherichia coli". Nucleic Acids Research. 27(1):59-60. [doi:10.1093/nar/27.1.59] | 9847141 |
1998 | Thieffry, D, Salgado, H, Huerta, AM, Collado-Vides, J. (1998). "Prediction of transcriptional regulatory sites in the complete genome sequence of Escherichia coli K-12". Bioinformatics. 14(5):391-400. [doi:10.1093/bioinformatics/14.5.391] | 9682052 |
1998 | Huerta, AM, Salgado, H, Thieffry, D, Collado-Vides, J. (1998). "RegulonDB: A database on transcriptional regulation in Escherichia coli". Nucleic Acids Research. 26(1):55-59. [doi:10.1093/nar/26.1.55] | 9399800 |
1997 | Thieffry Jacot-Descombes, Denis Louis, Rosenblueth, D.A., Huerta Moreno, Araceli, Salgado Osorio, Heladia, Collado Vides, Pedro Julio. (1997). "Definite-clause grammars for the analysis of CIS-regulatory regions in E. coli.". Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing. ():441-452. | 9390313 |
1996 | Rosenblueth, DA, Thieffry, D, Huerta, AM, Salgado, H, ColladoVides, J. (1996). "Syntactic recognition of regulatory regions in Escherichia coli". COMPUTER APPLICATIONS IN THE BIOSCIENCES. 12(5):415-422. [doi:10.1093/bioinformatics/12.5.415] | 8996790 |